光子脫毛器的原理是采用專利強脈沖光源的選擇性光熱解作用，這種脫毛器對正常表皮進行無損傷的光照射，穿透皮膚直達毛囊根部；隨后毛干和毛囊中的黑色素吸收并轉化成為熱能，從而升高毛囊溫度；而當溫度上升到足夠高時，毛囊結構發生不可逆轉的破壞，已破壞的毛發和毛囊經過一段自然生理過程而去除，而周圍其他組織不會受損傷，從而達到無痛脫毛。優質的光子脫毛器一般都會安裝有保護皮膚的冷卻裝置，大大降低疼痛感；其脈寬、脈沖數、冷卻時間、能量密度可調，還可以用來治療雀斑、痘印。