臺灣自古以(yi)(yi)(yi)來就與大陸的關(guan)系密(mi)不可分，所(suo)以(yi)(yi)(yi)統一是必然(ran)的規律和趨勢，特別是自元(yuan)朝以(yi)(yi)(yi)來，臺灣直(zhi)接歸于中央政府管(guan)轄。天啟四年(nian)(nian)（1624年(nian)(nian)）荷(he)蘭(lan)東印度公司部隊(dui)登(deng)陸大員(yuan)，開始(shi)(shi)占領臺灣。清兵入關(guan)后(hou)，勢力逐漸(jian)進入福(fu)建。順治十(shi)六年(nian)(nian)（1659年(nian)(nian)）鄭成功率領十(shi)萬大軍(jun)攻打(da)南(nan)京(jing)，慘敗(bai)而回。鄭軍(jun)元(yuan)氣(qi)大傷，鄭成功感到清朝統治逐漸(jian)穩固，而鄭軍(jun)困守思明（廈(sha)門(men)）孤島糧草匱乏，難以(yi)(yi)(yi)提供數萬大軍(jun)給養，開始(shi)(shi)思考取得另外的根(gen)據(ju)地以(yi)(yi)(yi)為整補。
順(shun)治(zhi)十(shi)八(ba)年(nian)（1661年(nian)）三月，鄭(zheng)成(cheng)功(gong)親率2.5萬名兵將(jiang)，分乘百(bai)艘戰(zhan)船，從(cong)金門(men)出(chu)發。他們冒著(zhu)風浪，越過臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)海(hai)峽，在(zai)澎湖休整幾天準(zhun)備直取臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)。荷(he)蘭(lan)侵(qin)(qin)略軍(jun)(jun)(jun)聽說(shuo)鄭(zheng)成(cheng)功(gong)要進(jin)攻臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)，十(shi)分驚恐。他們把軍(jun)(jun)(jun)隊集中(zhong)在(zai)臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)（今臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)東(dong)平地區）、赤嵌（今臺(tai)(tai)(tai)南）兩(liang)座城堡(bao)，還在(zai)港口(kou)沉破船阻止鄭(zheng)成(cheng)功(gong)船隊登岸(an)。鄭(zheng)軍(jun)(jun)(jun)乘海(hai)水(shui)漲潮將(jiang)船隊駛(shi)進(jin)鹿耳門(men)內海(hai)，主力從(cong)禾(he)寮港登陸，從(cong)側背進(jin)攻赤嵌城，并切斷(duan)了(le)與臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)城的(de)(de)聯(lian)系。戰(zhan)斗中(zhong)，侵(qin)(qin)略軍(jun)(jun)(jun)以“赫克托”號戰(zhan)艦攻擊(ji)，鄭(zheng)成(cheng)功(gong)一聲令下，把敵(di)軍(jun)(jun)(jun)緊(jin)緊(jin)圍住，60多(duo)只戰(zhan)船一齊發炮，把“赫克托”號擊(ji)沉。與此同時，又擊(ji)潰了(le)臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)城的(de)(de)援軍(jun)(jun)(jun)。赤嵌的(de)(de)荷(he)蘭(lan)軍(jun)(jun)(jun)在(zai)水(shui)源(yuan)被切斷(duan)，外援無(wu)望的(de)(de)情況(kuang)下，向鄭(zheng)軍(jun)(jun)(jun)投降。盤踞臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)城的(de)(de)侵(qin)(qin)略軍(jun)(jun)(jun)企圖負隅頑(wan)抗，鄭(zheng)成(cheng)功(gong)在(zai)城周圍修(xiu)筑土(tu)臺(tai)(tai)(tai)，圍困敵(di)軍(jun)(jun)(jun)8個月后(hou)，下令向臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)城發起強攻。至此，鄭(zheng)成(cheng)功(gong)從(cong)荷(he)蘭(lan)侵(qin)(qin)略者手里收(shou)復了(le)淪陷38年(nian)的(de)(de)中(zhong)國(guo)領土(tu)臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)。這場戰(zhan)爭結束(shu)了(le)荷(he)蘭(lan)東(dong)印度公司在(zai)中(zhong)國(guo)臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)的(de)(de)經營(ying)，開啟了(le)明鄭(zheng)政權對臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)的(de)(de)統治(zhi)。
清朝入(ru)關之(zhi)(zhi)(zhi)初，因(yin)忙于統一戰爭，無暇顧及臺(tai)灣。自從康(kang)熙以來，清朝內(nei)地(di)的(de)(de)反(fan)抗逐漸平息，政(zheng)局趨于穩(wen)固(gu)，而在(zai)臺(tai)灣的(de)(de)鄭(zheng)(zheng)氏則(ze)時刻想侵擾清政(zheng)權。鄭(zheng)(zheng)成(cheng)功收(shou)(shou)臺(tai)的(de)(de)次年(nian)(nian)即病逝，繼(ji)位的(de)(de)鄭(zheng)(zheng)經(jing)(jing)利(li)用康(kang)熙初年(nian)(nian)三藩(fan)之(zhi)(zhi)(zhi)亂(luan)的(de)(de)機(ji)會，渡海(hai)(hai)西攻清朝福建(jian)、廣東(dong)沿海(hai)(hai)。康(kang)熙十三年(nian)(nian)（1674年(nian)(nian)）耿精忠響應吳三桂發起的(de)(de)叛亂(luan)，以提供戰船(chuan)給鄭(zheng)(zheng)經(jing)(jing)，換取出(chu)(chu)兵，鄭(zheng)(zheng)經(jing)(jing)應允此(ci)(ci)事。泉州、漳(zhang)州、潮州陸(lu)續(xu)投靠(kao)鄭(zheng)(zheng)經(jing)(jing)。康(kang)熙十五年(nian)(nian)（1676年(nian)(nian)），廣東(dong)尚之(zhi)(zhi)(zhi)信再次遭鄭(zheng)(zheng)軍(jun)擊敗，只得加入(ru)三藩(fan)反(fan)清陣營，并將惠(hui)州割讓給鄭(zheng)(zheng)經(jing)(jing)。三藩(fan)之(zhi)(zhi)(zhi)亂(luan)后期，清軍(jun)逐漸占據(ju)優勢，鄭(zheng)(zheng)氏在(zai)閩粵沿海(hai)(hai)的(de)(de)勢力開始被(bei)驅(qu)逐出(chu)(chu)去。一方面，鄭(zheng)(zheng)氏不(bu)斷對東(dong)南沿海(hai)(hai)的(de)(de)侵襲影響到(dao)清朝東(dong)南賦稅(shui)之(zhi)(zhi)(zhi)地(di)的(de)(de)穩(wen)定，同時也(ye)不(bu)利(li)南方民(min)心的(de)(de)穩(wen)定；另一方面，臺(tai)灣的(de)(de)鄭(zheng)(zheng)氏也(ye)被(bei)認為(wei)是明(ming)朝正統，成(cheng)為(wei)反(fan)清復明(ming)的(de)(de)最后基地(di)。臺(tai)灣繼(ji)續(xu)孤懸(xuan)海(hai)(hai)外，不(bu)利(li)多(duo)民(min)族封建(jian)專制主義中央集權國家的(de)(de)鞏固(gu)和統一。因(yin)此(ci)(ci)，清朝收(shou)(shou)取臺(tai)灣勢在(zai)必(bi)行。
早在康(kang)(kang)熙(xi)初(chu)(chu)年，清(qing)朝(chao)(chao)就(jiu)與(yu)臺(tai)灣(wan)鄭(zheng)(zheng)(zheng)氏當(dang)(dang)局有了(le)交(jiao)流。在康(kang)(kang)熙(xi)元年（1662年）鄭(zheng)(zheng)(zheng)成(cheng)(cheng)(cheng)功病(bing)逝后(hou)(hou)不(bu)久(jiu)，清(qing)廷即派人(ren)前往廈(sha)門(men)招(zhao)撫(fu)鄭(zheng)(zheng)(zheng)經(jing)(jing)。其(qi)時，鄭(zheng)(zheng)(zheng)經(jing)(jing)與(yu)其(qi)叔(shu)父鄭(zheng)(zheng)(zheng)世襲火(huo)并正(zheng)烈，鄭(zheng)(zheng)(zheng)經(jing)(jing)害怕清(qing)廷“指(zhi)日加兵(bing)，內外受(shou)困”，因此(ci)，陽奉陰違(wei)，虛與(yu)應付(fu)，以“茍延歲(sui)月”。第(di)二年，鄭(zheng)(zheng)(zheng)經(jing)(jing)得(de)勢(shi)，則提出“請(qing)如(ru)琉(liu)球、朝(chao)(chao)鮮(xian)例，不(bu)登岸，不(bu)剔發易衣(yi)冠(guan)”。清(qing)廷當(dang)(dang)然不(bu)會答(da)應，雙方仍(reng)成(cheng)(cheng)(cheng)對峙局面(mian)。當(dang)(dang)年十(shi)月，清(qing)軍分三路攻廈(sha)門(men)等地(di)，清(qing)軍擊敗(bai)鄭(zheng)(zheng)(zheng)軍，攻占了(le)廈(sha)門(men)。鄭(zheng)(zheng)(zheng)經(jing)(jing)退(tui)守銅(tong)山(shan)。后(hou)(hou)鄭(zheng)(zheng)(zheng)軍軍官眼看(kan)大(da)(da)勢(shi)已去，紛紛率兵(bing)降清(qing)，致使鄭(zheng)(zheng)(zheng)軍在大(da)(da)陸沿海(hai)據點紛紛失(shi)守。康(kang)(kang)熙(xi)三年（1664年）清(qing)廷授福建(jian)提督水(shui)師(shi)總(zong)兵(bing)官施瑯(lang)為(wei)靖海(hai)將軍，令其(qi)統帥水(shui)師(shi)，前往征剿(jiao)鄭(zheng)(zheng)(zheng)經(jing)(jing)。施瑯(lang)率水(shui)師(shi)先(xian)(xian)后(hou)(hou)三次(ci)(ci)渡海(hai)，均因臺(tai)風襲擊而未成(cheng)(cheng)(cheng)功。康(kang)(kang)熙(xi)六年（1667年），清(qing)廷又派福建(jian)招(zhao)撫(fu)總(zong)兵(bing)官孔元章先(xian)(xian)后(hou)(hou)兩次(ci)(ci)渡海(hai)招(zhao)撫(fu)鄭(zheng)(zheng)(zheng)經(jing)(jing)，但(dan)鄭(zheng)(zheng)(zheng)經(jing)(jing)仍(reng)頑固地(di)堅持所謂“朝(chao)(chao)鮮(xian)例”，招(zhao)撫(fu)未成(cheng)(cheng)(cheng)。康(kang)(kang)熙(xi)七年（1668年）初(chu)(chu)令施瑯(lang)來京師(shi)，商討進(jin)兵(bing)臺(tai)灣(wan)的大(da)(da)計。施瑯(lang)到京師(shi)后(hou)(hou)，詳陳武(wu)力統一(yi)臺(tai)灣(wan)的意見(jian)，但(dan)因當(dang)(dang)時天下初(chu)(chu)定，沿海(hai)地(di)區人(ren)心未穩，施瑯(lang)的意見(jian)未被(bei)采納。不(bu)過，康(kang)(kang)熙(xi)帝意識到武(wu)力統一(yi)臺(tai)灣(wan)只(zhi)是時間問題(ti)，因此(ci)盡管未采納施瑯(lang)的意見(jian)，但(dan)命他為(wei)內大(da)(da)臣，留在京師(shi)，以備應急之用。
三藩之亂(luan)結束(shu)后，清朝的(de)(de)統治更加穩固，收復臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)事宜就被提(ti)(ti)上了日程。康(kang)熙(xi)(xi)帝(di)玄燁對收取臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)的(de)(de)事務十(shi)分熱心，康(kang)熙(xi)(xi)十(shi)六(liu)年(nian)(nian)(nian)（1677年(nian)(nian)(nian)），康(kang)熙(xi)(xi)帝(di)恢復福(fu)建(jian)水(shui)師體(ti)制(zhi)；康(kang)熙(xi)(xi)十(shi)八年(nian)(nian)(nian)（1679年(nian)(nian)(nian)），康(kang)熙(xi)(xi)帝(di)任命(ming)湖南岳州水(shui)師總(zong)兵官(guan)(guan)萬正(zheng)(zheng)色(se)(se)為福(fu)建(jian)水(shui)師提(ti)(ti)督。至(zhi)是年(nian)(nian)(nian)年(nian)(nian)(nian)底，福(fu)建(jian)水(shui)師有戰船240艘，官(guan)(guan)兵28580名。康(kang)熙(xi)(xi)十(shi)九年(nian)(nian)(nian)（1680年(nian)(nian)(nian)），鄭經(jing)和清朝的(de)(de)戰爭失利，放棄廈門(men)、金(jin)門(men)，退往(wang)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)。福(fu)建(jian)總(zong)督姚啟(qi)圣打算趁(chen)勢進攻臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)，但(dan)遭福(fu)建(jian)水(shui)師提(ti)(ti)督萬正(zheng)(zheng)色(se)(se)反對，加上一些(xie)大臣支持萬正(zheng)(zheng)色(se)(se)的(de)(de)看法，康(kang)熙(xi)(xi)帝(di)也顧慮在西(xi)南的(de)(de)吳世璠(fan)未解決，決定暫緩進攻。
康(kang)熙二十(shi)年(nian)（1681年(nian)），鄭經中風而(er)死，鄭氏臺(tai)灣(wan)內部發(fa)生政(zheng)變(bian)，年(nian)僅12歲的(de)鄭克塽繼任(ren)延平王(wang)，大權實際上為(wei)馮錫范、劉國軒掌握，鄭氏官員向心力開始動搖，負責與清朝談和的(de)傅為(wei)霖甚至(zhi)愿(yuan)當內應。姚(yao)啟圣(sheng)(sheng)認為(wei)是進攻臺(tai)灣(wan)的(de)好時機，但萬正(zheng)色(se)仍(reng)反對出兵。姚(yao)啟圣(sheng)(sheng)知道(dao)施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)仇視鄭氏王(wang)朝，必能幫助他擊敗鄭軍，便向康(kang)熙帝推薦施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)。康(kang)熙帝也不滿萬正(zheng)色(se)反戰的(de)態度，便同(tong)意施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)擔任(ren)水師提督，萬正(zheng)色(se)調任(ren)陸師提督。
按照康熙帝(di)規劃，應由姚啟(qi)(qi)圣、萬正色、巡撫(fu)吳(wu)(wu)興祚一起(qi)商(shang)討(tao)作戰，施瑯(lang)卻打算排除(chu)姚啟(qi)(qi)圣等(deng)人的節制，以(yi)便能全權(quan)進攻臺灣，不過康熙帝(di)只同意吳(wu)(wu)興祚負責后勤，仍然(ran)命(ming)令姚啟(qi)(qi)圣和施瑯(lang)共同出兵。
康熙(xi)二十(shi)一年五月(yue)(yue)(yue)初(chu)(chu)五（1682年6月(yue)(yue)(yue)10日），清軍抵達銅山(shan)島，姚(yao)(yao)啟圣和施瑯卻在爭執出(chu)兵時機，姚(yao)(yao)啟圣主(zhu)張(zhang)利(li)(li)用(yong)冬(dong)天的北(bei)風(feng)，施瑯主(zhu)張(zhang)利(li)(li)用(yong)夏天的南風(feng)，導(dao)致清軍無(wu)法順利(li)(li)出(chu)兵。最后康熙(xi)帝(di)于十(shi)月(yue)(yue)(yue)初(chu)(chu)六(liu)（11月(yue)(yue)(yue)15日）裁(cai)定(ding)施瑯負責前線作戰，姚(yao)(yao)啟圣改任后勤作業(ye)，才讓(rang)施瑯如愿(yuan)取得統帥權。十(shi)一月(yue)(yue)(yue)初(chu)(chu)三（12月(yue)(yue)(yue)1日）施瑯率領約21000人，軍艦238艘前往興(xing)化平(ping)海衛訓(xun)練軍隊。
姚啟圣軍權旁(pang)落后(hou)，為避免施(shi)瑯獨(du)得戰功，轉而和(he)鄭氏王(wang)朝談判。但是施(shi)瑯主(zhu)戰意志堅決，且負(fu)責談判的(de)劉(liu)國軒不接受剃發易服，談判因(yin)(yin)此破裂。康(kang)熙(xi)二十(shi)二年五月廿三日（1683年6月17日）康(kang)熙(xi)帝下令(ling)施(shi)瑯盡速進攻，因(yin)(yin)此爆發六月（陽歷7月）的(de)澎湖海戰。
康熙十八(ba)年(nian)（1679年(nian)）起，清(qing)朝實(shi)施遷(qian)界令，嚴(yan)重(zhong)打擊鄭氏王朝的貿易，糧(liang)食補給也出現問題，鄭經下令每戶人(ren)家(jia)每個月必須多繳一斗米，將領也必須用自己的俸祿(lu)充軍(jun)，仍沒辦(ban)法解除(chu)危機。當時英國商館就如此看待鄭氏王朝：“臺灣王之(zhi)境況(kuang)甚不(bu)(bu)(bu)安定，不(bu)(bu)(bu)易抵抗滿(man)清(qing)人(ren)，滿(man)清(qing)人(ren)常施恫赫，國王因其(qi)財(cai)富被消(xiao)耗，故每日向(xiang)人(ren)民橫征暴斂，亦不(bu)(bu)(bu)能使軍(jun)隊(dui)滿(man)意。是以我國不(bu)(bu)(bu)惟受(shou)敵(di)人(ren)（清(qing)軍(jun)）之(zhi)威脅，亦恐軍(jun)隊(dui)（鄭軍(jun)）因缺餉而叛變。”
康熙十九(jiu)年（1680年），鄭(zheng)經(jing)退(tui)守臺灣后，澎湖(hu)(hu)(hu)成為(wei)前線(xian)要地(di)，防守卻很薄弱。直(zhi)到十月(yue)，施瑯抵(di)達(da)廈門(men)以及傅為(wei)霖為(wei)清(qing)軍(jun)內應事情爆發，劉(liu)國軒(xuan)才前往(wang)澎湖(hu)(hu)(hu)強化(hua)守備(bei)。劉(liu)國軒(xuan)抵(di)達(da)澎湖(hu)(hu)(hu)后，在娘媽宮、風柜尾、四角嶼(yu)(yu)、雞籠嶼(yu)(yu)筑城；東蒔、西蒔、內塹、外塹、西嶼(yu)(yu)頭、牛心山設置炮臺。同時在海邊建造矮墻并配置火銃(chong)，阻止清(qing)軍(jun)登陸(lu)。
康熙(xi)二十二年（1683年），劉(liu)國軒得(de)知(zhi)施瑯準(zhun)備(bei)進攻，便從臺灣本島調度(du)鄉兵到澎湖(hu)，并將商船(chuan)以及私人(ren)用船(chuan)都改為軍艦（大小炮船(chuan)、鳥船(chuan)、趕繒船(chuan)、洋船(chuan)、雙帆等各(ge)式(shi)戰(zhan)船(chuan)約200艘），準(zhun)備(bei)決戰(zhan)。
康(kang)熙(xi)二(er)(er)十(shi)二(er)(er)年(nian)六月(yue)十(shi)四(si)日(ri)(ri)（1683年(nian)7月(yue)8日(ri)(ri)），施(shi)(shi)瑯從銅山島出發，姚啟圣也(ye)撥(bo)3000人(ren)同施(shi)(shi)瑯出征（清軍(jun)(jun)24000人(ren)，大鳥船(chuan)(chuan)70艘、趕繒船(chuan)(chuan)103艘、雙帆居船(chuan)(chuan)65艘）。十(shi)五日(ri)(ri)（9日(ri)(ri)）鄭軍(jun)(jun)哨船(chuan)(chuan)發現清軍(jun)(jun)已到花嶼、貓嶼一帶，趕緊回報劉國軒，當晚清軍(jun)(jun)在(zai)八罩島過夜。
十六日（10日）施瑯進攻娘媽宮，以(yi)速度(du)快的鳥(niao)船當作(zuo)先(xian)鋒。劉(liu)國軒(xuan)讓林升、江勝指(zhi)揮(hui)水軍(jun)(jun)；邱輝(hui)為先(xian)鋒，自(zi)己在娘媽宮港口督戰。當時(shi)受(shou)風勢阻擾，清軍(jun)(jun)不(bu)敢(gan)前進，只有以(yi)藍理為首的7只艦隊突入鄭軍(jun)(jun)。
施瑯再派出第(di)二(er)波鳥(niao)船部隊，交(jiao)戰不久后開始漲潮(chao)，一些(xie)清軍(jun)(jun)(jun)船只(zhi)被(bei)海(hai)水沖向岸邊，鄭軍(jun)(jun)(jun)趁勢將艦隊分(fen)成(cheng)兩(liang)翼包(bao)圍(wei)清軍(jun)(jun)(jun)。施瑯見(jian)狀趕(gan)緊突(tu)入鄭軍(jun)(jun)(jun)，想解救被(bei)圍(wei)困的船只(zhi)，卻被(bei)林升(sheng)率軍(jun)(jun)(jun)包(bao)圍(wei)。施瑯在(zai)交(jiao)戰中被(bei)火銃射傷(shang)右眼(yan)，不過沒有失明；林升(sheng)也被(bei)大炮打斷(duan)左腿。林升(sheng)負傷(shang)讓鄭軍(jun)(jun)(jun)失去指(zhi)揮，施瑯借機撤離戰場(chang)，到(dao)西(xi)嶼附近的海(hai)上休息。
施(shi)瑯在(zai)十七日(ri)(ri)（11日(ri)(ri)）返回八(ba)罩島，八(ba)罩島地(di)形險惡(e)，船(chuan)只遇暴風(feng)(feng)很容易(yi)撞上島邊的(de)暗礁，農歷六月又(you)是容易(yi)發生臺(tai)風(feng)(feng)的(de)時節，施(shi)瑯卻很幸運沒碰(peng)到(dao)臺(tai)風(feng)(feng)。劉國軒(xuan)得知清軍(jun)在(zai)八(ba)罩島休息，親自進攻(gong)卻被(bei)施(shi)瑯擊退。施(shi)瑯趁勢在(zai)十八(ba)日(ri)(ri)（12日(ri)(ri)）先派戰船(chuan)攻(gong)取澎湖港外虎井嶼、桶盤嶼。
二(er)十二(er)日(ri)（16日(ri)）早(zao)七時，施瑯決(jue)定(ding)發(fa)動總攻(gong)擊，將艦隊(dui)分成三路進攻(gong)，剩下約80艘當后(hou)援(yuan)部隊(dui)：
中路：共有(you)56艘船(chuan)，分成(cheng)8隊(dui)，每隊(dui)有(you)7艘船(chuan)。由施瑯親自(zi)指揮，作(zuo)為主力進攻娘媽宮。
右路(lu)：共有50艘(sou)船，由總兵(bing)陳蠎等從(cong)澎(peng)湖港口東側東蒔攻(gong)入雞籠嶼、四角嶼，后會(hui)合(he)中央部隊(dui)夾攻(gong)鄭軍。
左路：共有50艘船(chuan)，由總兵董義等從澎(peng)湖港口(kou)西側(ce)內塹攻入(ru)牛心灣，讓鄭(zheng)軍誤判清軍要在(zai)此地(di)登陸。
天亮前(qian)，開始刮起(qi)臺風(feng)(feng)。辰時(shi)（7時(shi)—9時(shi)）受(shou)(shou)臺風(feng)(feng)影響(xiang)，海上吹起(qi)西北(bei)(bei)風(feng)(feng)，鄭(zheng)軍(jun)順著(zhu)風(feng)(feng)勢進攻(gong)，一(yi)時(shi)處于優(you)勢，清(qing)將朱天貴被炮(pao)擊(ji)而(er)死。到了中午，臺風(feng)(feng)受(shou)(shou)到赤(chi)道鋒面(mian)帶的(de)影響(xiang)，海上開始吹南風(feng)(feng)，風(feng)(feng)向轉變成對清(qing)軍(jun)有(you)利(li)。施瑯命令全軍(jun)反攻(gong)，順著(zhu)風(feng)(feng)勢發射各(ge)種(zhong)火器，并且以數船(chuan)圍攻(gong)鄭(zheng)軍(jun)一(yi)船(chuan)，鄭(zheng)軍(jun)全面(mian)崩(beng)潰(kui)，江勝戰(zhan)死、邱輝自焚。共斃傷(shang)鄭(zheng)軍(jun)12000人，俘5000余人。擊(ji)毀、繳獲戰(zhan)船(chuan)190余艘。劉國(guo)軒眼見大勢已去，率領殘(can)余部隊從北(bei)(bei)面(mian)吼門(men)退往臺灣，澎湖各(ge)島鄭(zheng)軍(jun)都向施瑯投(tou)降。清(qing)軍(jun)陣亡329人，傷(shang)1800余人，船(chuan)只無一(yi)損(sun)失。
施(shi)瑯(lang)戰勝(sheng)后，考慮臺灣(wan)水道非常險(xian)惡(e)，進軍困難。施(shi)瑯(lang)決(jue)定(ding)暫緩進攻，采取攻心戰術，讓鄭(zheng)氏王朝從(cong)內部崩潰。施(shi)瑯(lang)在澎湖禁止殺戮，張(zhang)榜安(an)民；發布(bu)《安(an)撫輸(shu)誠示》。派原(yuan)劉國(guo)軒副將(jiang)(jiang)曾蜚赴臺。派人醫治受(shou)傷戰俘，并(bing)配(pei)給他(ta)們衣服、糧食，再(zai)將(jiang)(jiang)士兵送回臺灣(wan)。還拉攏鄭(zheng)軍將(jiang)(jiang)領為(wei)內應，防守淡(dan)水的何(he)佑(you)首先私通施(shi)瑯(lang)，其他(ta)將(jiang)(jiang)領也跟(gen)進。
鄭軍戰(zhan)敗消息傳(chuan)到(dao)臺灣(wan)，人心開始不安。為了延續政(zheng)權的(de)生存，有將(jiang)領提出進攻菲律賓(bin)，得(de)到(dao)馮錫(xi)范同(tong)意。卻傳(chuan)出遠(yuan)征軍只(zhi)想搶劫(jie)，還打算逃往海外，因此劉國軒阻止(zhi)此計劃。七(qi)月(yue)(yue)十三(san)日(ri)(ri)（9月(yue)(yue)3日(ri)(ri)），施(shi)瑯率軍在臺灣(wan)登(deng)陸。后來在劉國軒大力主張下，鄭克塽(shuang)于七(qi)月(yue)(yue)十五日(ri)(ri)（9月(yue)(yue)5日(ri)(ri)）向(xiang)施(shi)瑯投降，并(bing)于八月(yue)(yue)十八日(ri)(ri)（10月(yue)(yue)8日(ri)(ri)）剃發易服，鄭氏王朝正式滅亡。
鄭(zheng)克(ke)塽投(tou)降后(hou)，清(qing)廷為(wei)了是(shi)否把臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)并(bing)入(ru)版(ban)圖(tu)產(chan)生爭論，不少大臣認為(wei)臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)孤懸(xuan)海上，治理以(yi)及防守花費不小，主(zhu)張棄守。最后(hou)施瑯以(yi)臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)戰略(lve)地位重要，說服清(qing)廷將臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)并(bing)入(ru)版(ban)圖(tu)。
施(shi)瑯(lang)(lang)軍(jun)(jun)隊(dui)到(dao)達(da)臺灣(wan)(wan)(wan)后，鄭(zheng)(zheng)(zheng)氏(shi)無力(li)抵抗清(qing)(qing)(qing)軍(jun)(jun)，只得(de)投降(jiang)，結束在臺灣(wan)(wan)(wan)歷經22年的(de)(de)統(tong)(tong)(tong)治(zhi)(zhi)，臺灣(wan)(wan)(wan)也因此成(cheng)為(wei)清(qing)(qing)(qing)朝的(de)(de)領土。康(kang)熙二(er)十(shi)二(er)年（1683年）六月(yue)十(shi)四日(ri)(ri)，施(shi)瑯(lang)(lang)率領戰(zhan)船300余艘，水(shui)師(shi)2萬余人，仍自(zi)銅山(shan)出洋，第二(er)天上(shang)午，戰(zhan)船即陸(lu)續(xu)到(dao)達(da)澎湖海(hai)外。十(shi)六日(ri)(ri)曾發(fa)生(sheng)小規模(mo)海(hai)戰(zhan)，雙方各有損傷。二(er)十(shi)二(er)日(ri)(ri)清(qing)(qing)(qing)軍(jun)(jun)分三路(lu)出擊，與鄭(zheng)(zheng)(zheng)軍(jun)(jun)決戰(zhan)，施(shi)瑯(lang)(lang)親率主力(li)擔(dan)任中路(lu)主攻。清(qing)(qing)(qing)軍(jun)(jun)利(li)用“風利(li)舟快，瞬息飛駛，居(ju)上(shang)風上(shang)流之勢(shi)，壓攻擠(ji)擊”，一鼓作氣，經過七(qi)八個(ge)小時激(ji)戰(zhan)，大敗鄭(zheng)(zheng)(zheng)軍(jun)(jun)。劉國軒率所剩(sheng)幾只小舟逃回(hui)臺灣(wan)(wan)(wan)。澎湖為(wei)臺灣(wan)(wan)(wan)門戶，一旦失守，臺灣(wan)(wan)(wan)即失去(qu)(qu)了屏障。由(you)于(yu)(yu)(yu)鄭(zheng)(zheng)(zheng)氏(shi)集團(tuan)政治(zhi)(zhi)腐敗，所以(yi)(yi)清(qing)(qing)(qing)廷統(tong)(tong)(tong)一臺灣(wan)(wan)(wan)得(de)到(dao)臺灣(wan)(wan)(wan)各族人民(min)的(de)(de)支持和擁護，清(qing)(qing)(qing)軍(jun)(jun)至(zhi)臺灣(wan)(wan)(wan)時“百(bai)姓壺漿相繼于(yu)(yu)(yu)路(lu)，海(hai)兵皆(jie)預(yu)制(zhi)清(qing)(qing)(qing)朝旗號(hao)以(yi)(yi)迎王師(shi)”。施(shi)瑯(lang)(lang)派員到(dao)臺灣(wan)(wan)(wan)勸(quan)降(jiang)，聯絡劉國軒。劉國軒見大勢(shi)已去(qu)(qu)，于(yu)(yu)(yu)是派兵監視鄭(zheng)(zheng)(zheng)氏(shi)統(tong)(tong)(tong)治(zhi)(zhi)集團(tuan)，鄭(zheng)(zheng)(zheng)克塽、馮錫范只得(de)上(shang)表(biao)求降(jiang)。八月(yue)，清(qing)(qing)(qing)軍(jun)(jun)勝利(li)進駐臺灣(wan)(wan)(wan)。
交戰雙方的兵(bing)力(li)大(da)體相當，鄭軍(jun)經營澎(peng)湖多年，設(she)防據守，以逸待勞；清軍(jun)渡海作戰，遠來疲(pi)憊。鄭軍(jun)處于有利態勢(shi)，而結果(guo)卻一(yi)敗涂地(di)，全軍(jun)覆沒。除(chu)政治腐敗，士氣不高以外，指(zhi)揮上的失著應是一(yi)個重要原因(yin)。
首(shou)先是防御部署上的(de)(de)錯誤。鄭軍(jun)(jun)只注意防守八(ba)(ba)罩(zhao)水(shui)道以(yi)北(bei)的(de)(de)北(bei)大山、西嶼、北(bei)山等(deng)大島，而忽視了(le)在八(ba)(ba)罩(zhao)水(shui)道以(yi)南的(de)(de)八(ba)(ba)罩(zhao)、虎井(jing)、桶(tong)盤、花嶼、貓(mao)嶼等(deng)諸小嶼設防，這(zhe)就使南來的(de)(de)清軍(jun)(jun)水(shui)師得以(yi)乘虛入據(ju)，成了(le)清軍(jun)(jun)駐泊、休整和出擊的(de)(de)前進基地(di)。
其次是(shi)消極防御，貽(yi)誤戰(zhan)機(ji)。當清軍水(shui)師經過30多(duo)小時的(de)航行，抵近澎(peng)湖時，鄭軍宣毅左鎮(zhen)邱(qiu)(qiu)(qiu)輝(hui)(hui)對劉(liu)國(guo)軒說(shuo)：“乘(cheng)彼(bi)(bi)船初到，安(an)澳未(wei)定，兵心尚搖，輝(hui)(hui)愿領煩船十(shi)只，同左虎衛江勝(sheng)(sheng)貫陣(zhen)卻之。”建威中(zhong)鎮(zhen)黃良驥也說(shuo)：“先發制人，半渡(du)而(er)擊，正合兵法。”劉(liu)國(guo)軒卻說(shuo)：“炮(pao)臺處處謹守，彼(bi)(bi)何(he)處灣(wan)泊(bo)？當此六(liu)月時候，一(yi)旦風(feng)(feng)起，則(ze)彼(bi)(bi)何(he)所容(rong)身？此乃以(yi)逸(yi)待(dai)勞，不戰(zhan)可(ke)收(shou)全功也。”遂(sui)按(an)兵不動(dong)，使清軍水(shui)師得以(yi)順利到達澎(peng)湖，環泊(bo)花、貓二嶼。邱(qiu)(qiu)(qiu)輝(hui)(hui)又建議：“乘(cheng)夜潮落，沖舟(zhou)宗擊之”，又遭拒絕。十(shi)六(liu)日，清軍出(chu)戰(zhan)不利，千帥受傷(shang)。邱(qiu)(qiu)(qiu)輝(hui)(hui)建議乘(cheng)勝(sheng)(sheng)夜襲(xi)，劉(liu)國(guo)軒仍以(yi)等待(dai)颶風(feng)(feng)使彼(bi)(bi)自覆為由未(wei)予采納(na)。邱(qiu)(qiu)(qiu)輝(hui)(hui)說(shuo)：“兵法有云：半渡(du)可(ke)擊，立營未(wei)定可(ke)擊，乘(cheng)虛(xu)可(ke)擊；今敵患(huan)三(san)者，而(er)不乘(cheng)其勢，若早晚無風(feng)(feng)，合萬人為一(yi)心而(er)死戰(zhan)，將(jiang)奈(nai)何(he)？”劉(liu)國(guo)軒不聽部屬的(de)合理建議，三(san)次放棄殲敵的(de)有利戰(zhan)機(ji)，把取(qu)勝(sheng)(sheng)的(de)希望完全寄(ji)托在(zai)可(ke)期而(er)不可(ke)必的(de)風(feng)(feng)暴上，結(jie)果(guo)是(shi)風(feng)(feng)未(wei)至而(er)兵已敗。
第(di)三是冒險決戰，全軍(jun)(jun)(jun)覆沒。戰史(shi)上因主(zhu)帥(shuai)胸無全局，遷就眼前事(shi)(shi)變(bian)，由消極防(fang)御變(bian)為冒險決戰的(de)事(shi)(shi)例(li)時有發(fa)生。鄭軍(jun)(jun)(jun)的(de)作戰方針本來是以澎湖為重點設防(fang)固守，劉(liu)國(guo)軒本人也不(bu)愿主(zhu)動出擊，而是指望(wang)海上風暴會使(shi)清軍(jun)(jun)(jun)不(bu)戰而敗。既然如此，就應該充分利(li)用防(fang)御工事(shi)(shi)，保存有生力量，避免與清軍(jun)(jun)(jun)決戰。劉(liu)國(guo)軒見(jian)不(bu)及(ji)此，當施瑯發(fa)起總攻(gong)時，亦率全部海上兵(bing)力迎戰，終于全軍(jun)(jun)(jun)覆沒。
在(zai)澎湖海戰(zhan)中，清軍(jun)之(zhi)所以(yi)取勝，除戰(zhan)船裝備精良，將(jiang)士作戰(zhan)勇(yong)敢(gan)之(zhi)外，也是(shi)(shi)與作戰(zhan)指(zhi)揮的(de)正確分不開的(de)。清軍(jun)水(shui)師統(tong)帥(shuai)施瑯“治(zhi)軍(jun)嚴整(zheng)，通陣法，尤善水(shui)戰(zhan)，諳海中風(feng)候(hou)”，因此在(zai)指(zhi)揮上(shang)有(you)許多(duo)獨到之(zhi)處。在(zai)渡海時間上(shang)，他一(yi)(yi)反在(zai)東北風(feng)季(ji)節渡海的(de)傳(chuan)統(tong)，選在(zai)西南風(feng)始(shi)發的(de)六月中旬。有(you)人間這是(shi)(shi)什么原故，施瑯說(shuo)：“北風(feng)日夜猛，今攻澎湖，未能(neng)一(yi)(yi)戰(zhan)克，風(feng)起舟散(san)，將(jiang)何以(yi)戰(zhan)？夏至(zhi)前(qian)后二十余日，風(feng)微，夜尤靜，可聚(ju)泊大洋(yang)，觀釁(xin)而功，不過七日，舉之(zhi)必矣(yi)。”
這種選(xuan)擇(ze)曾(ceng)經遭(zao)到姚啟圣等(deng)人的(de)(de)強烈反對，但施瑯始(shi)終(zhong)(zhong)不(bu)為所動。實戰(zhan)證明，這一(yi)(yi)選(xuan)擇(ze)是(shi)正(zheng)確(que)的(de)(de)，它(ta)保障了(le)清(qing)軍(jun)水(shui)師(shi)在發(fa)起(qi)總(zong)攻前的(de)(de)安全錨泊(bo)。在渡海航(hang)路上，以(yi)往從大(da)陸到臺(tai)灣，都從金、廈出(chu)航(hang)，而施瑯又一(yi)(yi)反慣(guan)例(li)，把出(chu)航(hang)點選(xuan)在靠南的(de)(de)銅山島。因為水(shui)師(shi)從銅山出(chu)航(hang)后(hou)(hou)可利用(yong)西(xi)南風(feng)，直取澎湖以(yi)南鄭軍(jun)未設防的(de)(de)諸島嶼，以(yi)作為前進基地(di)，然后(hou)(hou)向(xiang)(xiang)北轉入澎湖海域，這樣便始(shi)終(zhong)(zhong)處于(yu)順風(feng)順流的(de)(de)有利陣(zhen)位(wei)。實戰(zhan)證明，這種選(xuan)擇(ze)是(shi)正(zheng)確(que)的(de)(de)，取得(de)了(le)預期的(de)(de)效果(guo)。在戰(zhan)術上，集中(zhong)兵力，速(su)戰(zhan)速(su)決。澎湖海域六月(yue)多風(feng)，深諳海情的(de)(de)施瑯是(shi)知道的(de)(de)，在初戰(zhan)小挫之后(hou)(hou)，便立即抓緊再戰(zhan)準(zhun)備，并不(bu)失時機地(di)發(fa)起(qi)總(zong)攻。施瑯除分兵二路，從東(dong)、西(xi)兩個方(fang)向(xiang)(xiang)進行佯動和箝制(zhi)以(yi)外，在主攻方(fang)向(xiang)(xiang)上集中(zhong)了(le)56艘主力戰(zhan)船(chuan)(chuan)(chuan)，并以(yi)五船(chuan)(chuan)(chuan)合攻一(yi)(yi)船(chuan)(chuan)(chuan)，逐(zhu)次(ci)殲滅了(le)鄭軍(jun)主力，而清(qing)軍(jun)水(shui)師(shi)卻無(wu)一(yi)(yi)船(chuan)(chuan)(chuan)損失。一(yi)(yi)場大(da)規(gui)模海戰(zhan)，損傷如此懸殊，這在海戰(zhan)史上也屬鮮見。
清(qing)朝(chao)統(tong)(tong)一臺灣(wan)(wan)后，施瑯懇切陳(chen)辭，闡(chan)述利(li)害，得到大學士李蔚、工部侍(shi)郎(lang)蘇拜、都察院左御(yu)史趙麟等人的(de)贊(zan)同和支持(chi)，于是康熙帝(di)始決定堅(jian)守臺灣(wan)(wan)，在(zai)臺灣(wan)(wan)設臺灣(wan)(wan)府(fu)，下轄臺灣(wan)(wan)、諸羅、鳳山三縣(xian)，隸屬(shu)福建省。臺灣(wan)(wan)、廈(sha)門合派一道官管轄。并派兵(bing)(bing)8000人駐(zhu)防，設總兵(bing)(bing)一員(yuan)，副將(jiang)二員(yuan)，澎湖亦派副將(jiang)一員(yuan)統(tong)(tong)兵(bing)(bing)2000人駐(zhu)防。這(zhe)樣，臺灣(wan)(wan)重新統(tong)(tong)一于清(qing)王朝(chao)中央政府(fu)的(de)管轄。
施瑯：夫炎徼僻(pi)壤(rang)，職方不載；天威遐播，遂入(ru)版圖。推恩(en)陶俗，銷兵氣以光文治(zhi)，端有望于官斯土(tu)者。
楊(yang)文(wen)魁：從(cong)茲不(bu)特各省沿邊獲享敉寧，而化外來(lai)依赤(chi)子，快睹帡幪；土(tu)著蚩番，漸濡聲教。誠盛化無遠不(bu)屆，廓千古未有之弘模、啟千古未辟之遐陬也。
劉良璧：大業(ye)疏天派(pai)，膚(fu)功列上班。龍旗開(kai)敵壘，虎竹賁仙(xian)關(guan)。浪靜平甌越，烽(feng)晴靖(jing)海蠻。朱甍輝玉鑰(yao)，碧甃燦金環(huan)。謨(mo)烈(lie)青編著，賢良紫誥頒。勛(xun)名縈兩浙，世(shi)澤衍三山。頌溢(yi)鰲峰上，謳興鹿島(dao)間。東南槎萬里(li)，長(chang)此奉王顏。
高拱(gong)干：臺以海外地，明季(ji)通(tong)商，始(shi)有漢人(ren)。迨鄭氏遁踞，舊家世(shi)族或從(cong)而東，生(sheng)聚有年(nian)(nian)，而弦誦猶未(wei)廣(guang)也。越(yue)至于今(jin)，輸誠納土，島民(min)得睹天日；分設郡縣，招徠愈眾。十余(yu)年(nian)(nian)間(jian)，聲教大通(tong)，人(ren)文骎骎蔚(yu)起；即深(shen)山邃谷文身黑齒之番，皆知向風慕學。有識(shi)之士，咸謂治以道(dao)隆、道(dao)隨治廣(guang)；從(cong)此海波(bo)不揚(yang)，內(nei)外如鄒魯矣。
吳昌祚：維郡伯倡(chang)牧(mu)令，以(yi)靖地(di)寧人，厥任(ren)綦重；而(er)臺灣獨加難(nan)，孤懸海(hai)東，番(fan)黎雜處，縱長幾(ji)三千里，實為閩、粵(yue)、江(jiang)、浙之(zhi)(zhi)籬垣，非果卓(zhuo)循(xun)，豈易(yi)理此！辛(xin)丑夏，高(gao)君天木，特(te)奉(feng)簡調而(er)來。當(dang)其時匪變初(chu)平(ping)，大(da)(da)師云集(ji)(ji)，糗糧蒭茭立(li)待騰飽(bao)，君乃咄(duo)嗟辦之(zhi)(zhi)。捕黨孽、寬(kuan)脅從，全臺底定，襄力居多。已而(er)秋(qiu)颶為災，酷逾兵燹(xian)；請蠲、議賑(zhen)，心曲殫焉(yan)。由是集(ji)(ji)哀鴻、銷(xiao)偑犢，務簡靜以(yi)息耕，廣教化(hua)以(yi)培(pei)士。比及三載(zai)，民(min)用大(da)(da)和(he)；則君之(zhi)(zhi)大(da)(da)有造于斯臺，而(er)膏澤(ze)良已深矣。
夏之(zhi)(zhi)芳(fang)：臺灣(wan)僻處海(hai)隅，自入版圖歷(li)今，垂五十載。舊制：郡邑(yi)守(shou)令外，以(yi)觀(guan)察使領之(zhi)(zhi)。康(kang)熙六十年，始以(yi)臺臣出(chu)司(si)巡視，滿(man)、漢各一員，歲(sui)一更(geng)替；蓋(gai)重海(hai)疆(jiang)也。我皇上御極以(yi)來，文德覃敷、聲教(jiao)暨訖，休風(feng)雅化(hua)，已遍遐陬；猶于臨軒(xuan)遣策，如意遴選，再(zai)三訓(xun)誡，俾奉命(ming)諸臣得(de)所遵循(xun)，以(yi)為觀(guan)風(feng)訓(xun)俗之(zhi)(zhi)軌，則圣明洵周且至矣。
張湄：臺灣(wan)者，萬(wan)川(chuan)環流、一島中(zhong)屹，與世殊絕；六十年來(lai)，沐(mu)浴圣教，暗沕躍乎光明。海(hai)邦人士，璘(lin)璘(lin)然(ran)、紛(fen)紛(fen)然(ran)質有(you)其文矣(yi)。
白壽彝：清(qing)朝統(tong)(tong)一(yi)(yi)臺(tai)灣，使臺(tai)灣重新回到祖國統(tong)(tong)一(yi)(yi)的多(duo)民(min)族(zu)大家庭中，這不僅(jin)對國家統(tong)(tong)一(yi)(yi)具有重要(yao)意(yi)義(yi)，對臺(tai)灣的經濟、文化(hua)(hua)的進一(yi)(yi)步發展也(ye)具有重要(yao)意(yi)義(yi)。后(hou)來事實(shi)證(zheng)明，臺(tai)灣經濟、文化(hua)(hua)的進一(yi)(yi)步振興，正是在臺(tai)灣重新統(tong)(tong)一(yi)(yi)于清(qing)朝中央政(zheng)權管(guan)轄之(zhi)后(hou)。
丁紹儀：至是臺灣蕩平，民再(zai)康(kang)矣。臺灣滅而天(tian)下無(wu)事，詔息天(tian)下兵。
依據《天妃(fei)顯圣錄》記載(zai)：施瑯進(jin)攻澎湖時(shi)，抵達八罩島(dao)，島(dao)上缺乏(fa)淡(dan)水。清(qing)軍(jun)挖開退潮(chao)后的沙地，發現有淡(dan)水可(ke)供(gong)飲用。媽(ma)祖(zu)還告訴(su)清(qing)軍(jun)“二十一日必得澎湖，七月可(ke)得臺灣(wan)。”和鄭軍(jun)決戰(zhan)的日期，清(qing)軍(jun)將士還看到媽(ma)祖(zu)現身(shen)。施瑯認為是媽(ma)祖(zu)庇佑清(qing)軍(jun)戰(zhan)勝，因此于(yu)康熙二十三(san)年(nian)（1684年(nian)），康熙帝加封媽(ma)祖(zu)為護(hu)國庇民妙靈昭(zhao)應仁(ren)慈天后。
