主要保護對象為(wei)紅樹林濕地、獼(mi)(mi)猴、鳥類及(ji)海島生態環境,是研(yan)究濕地生態系(xi)統、候鳥以及(ji)獼(mi)(mi)猴原(yuan)生地和(he)發展史的重要基地。
淇澳紅(hong)(hong)樹(shu)(shu)林(lin)(lin)保護區內擁(yong)有維管植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)165科(ke)(ke)(ke)470屬(shu)695種（野生(sheng)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)140科(ke)(ke)(ke)398屬(shu)556種，栽培植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)65科(ke)(ke)(ke)106屬(shu)139種）。在野生(sheng)維管植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)中(zhong)，其中(zhong)蕨類(lei)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)19科(ke)(ke)(ke)28屬(shu)39種；裸子植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)3科(ke)(ke)(ke)3屬(shu)4種，被子植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)118科(ke)(ke)(ke)367屬(shu)513種。其中(zhong)紅(hong)(hong)樹(shu)(shu)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)達(da)10科(ke)(ke)(ke)13屬(shu)15種，分(fen)別(bie)占(zhan)中(zhong)國現有紅(hong)(hong)樹(shu)(shu)科(ke)(ke)(ke)、屬(shu)、種的83.3%、86.7%和55.6%；半紅(hong)(hong)樹(shu)(shu)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)達(da)7科(ke)(ke)(ke)9屬(shu)9種，分(fen)別(bie)占(zhan)中(zhong)國現有半紅(hong)(hong)樹(shu)(shu)科(ke)(ke)(ke)、屬(shu)、種的77.8%、90%和90%；紅(hong)(hong)樹(shu)(shu)林(lin)(lin)伴生(sheng)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)為(wei)11科(ke)(ke)(ke)15屬(shu)15種，分(fen)別(bie)占(zhan)中(zhong)國紅(hong)(hong)樹(shu)(shu)林(lin)(lin)伴生(sheng)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)科(ke)(ke)(ke)、屬(shu)、種的73.3%、71.4%和68.2%。
擔桿島獼猴(hou)保護區(qu)內擁有(you)維管植物(wu)(wu)438種(zhong)（含9變種(zhong)），分(fen)隸(li)320屬(shu)(shu)123科。其中蕨類植物(wu)(wu)22種(zhong)，分(fen)隸(li)18屬(shu)(shu)17科；裸子(zi)植物(wu)(wu)7種(zhong)，分(fen)隸(li)5屬(shu)(shu)5科；雙(shuang)子(zi)葉植物(wu)(wu)342種(zhong)8變種(zhong)，分(fen)隸(li)250屬(shu)(shu)86科；單子(zi)葉植物(wu)(wu)58種(zhong)1變種(zhong)，分(fen)隸(li)47屬(shu)(shu)15科。屬(shu)(shu)國家(jia)3級重點保護植物(wu)(wu)有(you)土沉香、吊皮錐和白(bai)桂木三種(zhong)。
淇澳島：區內擁有底棲(qi)(qi)動(dong)(dong)物(wu)(wu)(wu)(wu)103種(zhong)(zhong)(zhong)，隸(li)屬5綱(gang)，14目48科；魚(yu)類90種(zhong)(zhong)(zhong)，隸(li)屬10目，41科；陸生(sheng)脊椎野生(sheng)動(dong)(dong)物(wu)(wu)(wu)(wu)154種(zhong)(zhong)(zhong)（含兩棲(qi)(qi)動(dong)(dong)物(wu)(wu)(wu)(wu)15種(zhong)(zhong)(zhong)，爬(pa)行動(dong)(dong)物(wu)(wu)(wu)(wu)27種(zhong)(zhong)(zhong)，鳥類99種(zhong)(zhong)(zhong)，哺乳動(dong)(dong)物(wu)(wu)(wu)(wu)13種(zhong)(zhong)(zhong)）隸(li)屬25目，58科。屬國家(jia)重點(dian)(dian)保(bao)(bao)護動(dong)(dong)物(wu)(wu)(wu)(wu)（珍稀瀕危(wei)動(dong)(dong)物(wu)(wu)(wu)(wu)）15種(zhong)(zhong)(zhong)，占廣東省珍稀瀕危(wei)動(dong)(dong)物(wu)(wu)(wu)(wu)總數（117種(zhong)(zhong)(zhong)）的12.8%，其中國家(jia)一級重點(dian)(dian)保(bao)(bao)護動(dong)(dong)物(wu)(wu)(wu)(wu)有1種(zhong)(zhong)(zhong)，二(er)級重點(dian)(dian)保(bao)(bao)護動(dong)(dong)物(wu)(wu)(wu)(wu)14種(zhong)(zhong)(zhong)。
擔桿島：區(qu)內擁有(you)野生(sheng)動物(wu)85種，分隸34科、19目。其(qi)中獸類10種；鳥類60種；爬行(xing)類10種；兩棲(qi)類5種。屬國(guo)家(jia)1級重點保護(hu)動物(wu)有(you)蟒(mang)蛇1種；國(guo)家(jia)2級保護(hu)動物(wu)獼猴、穿山甲(jia)、松雀(que)鷹、雀(que)鷹、鳶、褐翅(chi)鴉鵑、長耳鸮(xiao)和虎紋蛙(wa)等9種。
淇澳島紅樹(shu)林自(zi)然保護區，位于(yu)廣東(dong)省珠(zhu)海市(shi)淇澳島西北(bei)(bei)部(bu)，地理(li)位置居于(yu)東(dong)經113°36′40〞~113°39′15〞，北(bei)(bei)緯22°23′40〞~22°27′38〞之間，東(dong)南、西南與該島大(da)澳圍、東(dong)涌(yong)、西涌(yong)、石井(jing)灣接壤，西北(bei)(bei)及東(dong)北(bei)(bei)與中山、深圳、香港隔海相望，總面積5103.77公頃。
擔桿(gan)島自然保護(hu)區，位(wei)于(yu)珠江入海(hai)中(zhong)，北距(ju)香港(gang)、深圳分別(bie)為20km和(he)78km，西北距(ju)澳門、珠海(hai)分別(bie)為72km和(he)74km。地理位(wei)置在(zai)東經(jing)114°07′~114°19′，北緯21°58′~22°04′。包括擔桿(gan)島、二洲島，總面積2270公頃(qing)。
1989年(nian)11月，廣東(dong)省人民政府批準建立擔(dan)桿島獼猴(hou)省級(ji)自(zi)然保護區。
1990年(nian)6月，成立(li)珠海市擔桿(gan)島獼猴保(bao)護區管理站，由市綠化委員會(hui)管理。
2000年4月，珠(zhu)海市人民政府(fu)批準成立“淇澳紅樹林(lin)保護區”，由(you)淇澳管(guan)理(li)區管(guan)理(li)。
2002年2月(yue)，市林(lin)業局正式接管(guan)淇澳紅(hong)樹林(lin)保(bao)護(hu)區(qu)，擔(dan)桿島(dao)省級自然保(bao)護(hu)區(qu)由(you)市野生(sheng)動植(zhi)物(wu)保(bao)護(hu)管(guan)理站(zhan)接管(guan)，盧海洋站(zhan)長兼管(guan)全面工作(zuo)。
2004年11月(yue)，廣(guang)東省(sheng)人民政府批準(zhun)同意將淇(qi)澳島自(zi)(zi)然(ran)保護(hu)區和擔(dan)桿島省(sheng)級自(zi)(zi)然(ran)保護(hu)區合并(bing)，建立(li)“珠海淇(qi)澳—擔(dan)桿島省(sheng)級自(zi)(zi)然(ran)保護(hu)區”。
2006年1月，珠(zhu)海淇澳—擔桿(gan)島省級自然保護區管理處(chu)籌建正(zheng)式(shi)完(wan)成(cheng)，并獨立辦公。
珠海(hai)淇澳—擔桿島省級自然保護區與中國林(lin)科(ke)院熱帶林(lin)業研(yan)究所合(he)作申報的國家(jia)科(ke)技部農業科(ke)技成果轉化資金項(xiang)(xiang)目《紅(hong)樹(shu)(shu)林(lin)濕地植被快速恢復(fu)(fu)技術應用示范》和國家(jia)“十一(yi)五(wu)”科(ke)技攻關項(xiang)(xiang)目專項(xiang)(xiang)《華(hua)南沿海(hai)紅(hong)樹(shu)(shu)林(lin)保護與恢復(fu)(fu)重建技術試驗示范》最(zui)近已獲得(de)國家(jia)科(ke)技部批準，項(xiang)(xiang)目即(ji)將在淇澳島紅(hong)樹(shu)(shu)林(lin)保護區全面展開。
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