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保護區(qu)位(wei)于甘肅(su)省(sheng)西端的(de)敦(dun)煌市南湖(hu)鄉境內(nei)，總(zong)面積(ji)(ji)8.81777萬公頃，東(dong)為黨河水庫(ku)，西隔(ge)甘肅(su)敦(dun)煌西湖(hu)國家級自然(ran)保護區(qu)而見(jian)一望無際的(de)庫(ku)姆塔格沙漠，南接阿克賽哈薩(sa)克族自治縣，北(bei)面則(ze)是大面積(ji)(ji)的(de)戈壁(bi)荒漠。
全區年(nian)降水量平均值為(wei)36.8--153.8毫米(mi),年(nian)日照時(shi)數3033.4--3316.5小時(shi)，具有典型的(de)大(da)陸性荒漠氣候特點。
敦煌陽關自然保護(hu)區始建(jian)于(yu)1992年(nian)，地處河西(xi)走廊坳陷(xian)之(zhi)西(xi)端(duan)，祁連山褶皺帶，位于(yu)瓜州(zhou)—敦煌盆(pen)地西(xi)南邊緣的陽關小(xiao)盆(pen)地。
1994年經省政府批準晉升為(wei)省級自然(ran)保(bao)護區。
2006年，為了認(ren)真(zhen)貫徹(che)落實溫家(jia)寶(bao)總理關于“敦(dun)煌生態保(bao)護(hu)(hu)工作，必須高(gao)度重視，科(ke)學規劃，綜合治(zhi)理，加(jia)快(kuai)進行。“絕不能(neng)讓敦(dun)煌變(bian)成(cheng)第二個樓蘭”的重要批示精神，敦(dun)煌市政府在(zai)國家(jia)環保(bao)部的指導下，正式啟動了敦(dun)煌陽關省級(ji)自然保(bao)護(hu)(hu)區晉升國家(jia)級(ji)自然保(bao)護(hu)(hu)區的申報(bao)工作。
2009年9月正(zheng)式(shi)獲(huo)得(de)了國(guo)務院(yuan)的審批命名，晉(jin)升(sheng)為國(guo)家級自然保(bao)護區。
敦煌(huang)陽關國家級自(zi)然(ran)保護區總面(mian)積為8.81777萬(wan)(wan)公頃，其(qi)中核心區面(mian)積為2.7322萬(wan)(wan)公頃，緩沖區面(mian)積為2.80826萬(wan)(wan)公頃，實驗區面(mian)積為3.27731萬(wan)(wan)公頃。
敦煌市氣(qi)象局為(wei)陽(yang)關自(zi)(zi)然(ran)保(bao)護區(qu)和西湖自(zi)(zi)然(ran)保(bao)護區(qu)建立了(le)(le)無人區(qu)域自(zi)(zi)動(dong)站以及(ji)敦煌市建成的(de)西北地區(qu)戈壁荒漠生態與環(huan)境研究站，為(wei)自(zi)(zi)然(ran)保(bao)護區(qu)的(de)保(bao)護和發展提供了(le)(le)科學(xue)依(yi)據和氣(qi)象保(bao)障。
保護(hu)區是中國(guo)(guo)西(xi)部干旱荒漠區中較為(wei)罕見(jian)的(de)特殊成(cheng)因內(nei)陸(lu)河流生(sheng)態系統，保護(hu)區的(de)濕(shi)地是中國(guo)(guo)西(xi)部荒漠區重要的(de)候鳥(niao)棲息地和遷徙驛站(zhan)，生(sheng)存著各(ge)種(zhong)(zhong)鳥(niao)類(lei)87種(zhong)(zhong)，其中候鳥(niao)50種(zhong)(zhong)，列(lie)(lie)入國(guo)(guo)家一、二級保護(hu)鳥(niao)類(lei)有16種(zhong)(zhong)，列(lie)(lie)入IUCN保護(hu)名(ming)錄的(de)有2種(zhong)(zhong)，列(lie)(lie)入《瀕(bin)危(wei)野生(sheng)動物(wu)國(guo)(guo)際貿易公約》的(de)有8種(zhong)(zhong)，列(lie)(lie)入《中國(guo)(guo)瀕(bin)危(wei)動物(wu)紅皮書》的(de)有3種(zhong)(zhong)。
白尾海雕是(shi)大(da)型猛禽(qin)，被(bei)列入《世界自然保護聯盟》（IUCN） 2012年瀕危物種紅色名錄，屬(shu)于國家一級保護動物。
保(bao)護(hu)區還生長著各類種(zhong)子植(zhi)物(wu)141種(zhong)，其中國(guo)家重點(dian)保(bao)護(hu)珍稀(xi)瀕危(wei)植(zhi)物(wu)4種(zhong)。
敦(dun)煌(huang)陽關(guan)國家級自然保(bao)(bao)(bao)(bao)護(hu)區(qu)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)建(jian)立，對積極探索極端干旱區(qu)荒(huang)(huang)漠(mo)(mo)濕(shi)地(di)(di)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)治理、水環(huan)境(jing)改善和(he)生(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)多樣性保(bao)(bao)(bao)(bao)護(hu)，實(shi)現濕(shi)地(di)(di)生(sheng)(sheng)(sheng)態(tai)環(huan)境(jing)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)重建(jian)，對研究(jiu)我國西(xi)部(bu)荒(huang)(huang)漠(mo)(mo)區(qu)濕(shi)地(di)(di)與荒(huang)(huang)漠(mo)(mo)復合生(sheng)(sheng)(sheng)態(tai)系統的(de)(de)(de)(de)(de)(de)變遷和(he)演替(ti)，保(bao)(bao)(bao)(bao)存野(ye)生(sheng)(sheng)(sheng)動植物(wu)(wu)種質的(de)(de)(de)(de)(de)(de)遺(yi)傳多樣性和(he)棲息(xi)地(di)(di)，保(bao)(bao)(bao)(bao)護(hu)和(he)拯救瀕危物(wu)(wu)種，開展生(sheng)(sheng)(sheng)態(tai)學研究(jiu)具有獨特的(de)(de)(de)(de)(de)(de)價值(zhi)，對甘(gan)肅河西(xi)走廊乃至中國西(xi)部(bu)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)生(sheng)(sheng)(sheng)態(tai)安全，莫高(gao)窟(ku)、月牙泉(quan)、陽關(guan)遺(yi)址等著名文化古跡和(he)自然景觀的(de)(de)(de)(de)(de)(de)保(bao)(bao)(bao)(bao)護(hu)，以(yi)及甘(gan)、青(qing)、新三省區(qu)交界(jie)處生(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)多樣性保(bao)(bao)(bao)(bao)護(hu)都有著重大意義。保(bao)(bao)(bao)(bao)護(hu)區(qu)濕(shi)地(di)(di)良好的(de)(de)(de)(de)(de)(de)荒(huang)(huang)漠(mo)(mo)植被、濕(shi)地(di)(di)中充足的(de)(de)(de)(de)(de)(de)水源和(he)飼料為黑鸛和(he)鵝喉羚等珍稀瀕危動物(wu)(wu)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)生(sheng)(sheng)(sheng)存和(he)繁衍提供了保(bao)(bao)(bao)(bao)障。
