臺北醫學大學原名臺北醫學院，創立于1960年6月1日，是醫學專家暨熱心醫藥教育人士胡水旺先生與徐千田先生等所捐資創設。創校之初，校地盡是一片荒蕪水田，教學與研究資源匱乏，四十八年來，在歷屆校(xiao)長的努力下，從(cong)創校(xiao)之三學(xue)(xue)(xue)系二(er)專(zhuan)科，擴展為(wei)現有(you)醫(yi)(yi)學(xue)(xue)(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)、口腔醫(yi)(yi)學(xue)(xue)(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)、藥(yao)學(xue)(xue)(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)、護理學(xue)(xue)(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)、公共(gong)衛生暨營養(yang)學(xue)(xue)(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)五個學(xue)(xue)(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)，十三學(xue)(xue)(xue)系及十三研(yan)究所(suo)之規模。自從(cong)2000年改名臺北醫(yi)(yi)學(xue)(xue)(xue)大(da)學(xue)(xue)(xue)以來，便一直以成為(wei)國際一流醫(yi)(yi)學(xue)(xue)(xue)大(da)學(xue)(xue)(xue)為(wei)目(mu)標，持(chi)續努力。
在(zai)教(jiao)(jiao)學(xue)方面，作(zuo)為一所都會型(xing)醫(yi)學(xue)專(zhuan)(zhuan)業(ye)(ye)大(da)學(xue)，臺北醫(yi)學(xue)大(da)學(xue)的(de)教(jiao)(jiao)育理念(nian)，在(zai)于教(jiao)(jiao)導學(xue)生醫(yi)學(xue)專(zhuan)(zhuan)業(ye)(ye)知識之外，同時(shi)重視博雅教(jiao)(jiao)育，回歸以(yi)(yi)人(ren)為本的(de)教(jiao)(jiao)學(xue)。在(zai)這(zhe)樣(yang)的(de)理念(nian)上，自2006年起，連續三年獲得教(jiao)(jiao)育部(bu)教(jiao)(jiao)學(xue)卓越計劃補(bu)助(zhu)，獲得肯(ken)定。為落實該校結合醫(yi)學(xue)科技與人(ren)文(wen)教(jiao)(jiao)育的(de)理想，深(shen)化(hua)人(ren)文(wen)與通識教(jiao)(jiao)育，學(xue)校以(yi)(yi)專(zhuan)(zhuan)業(ye)(ye)教(jiao)(jiao)育通識化(hua)、通識教(jiao)(jiao)育專(zhuan)(zhuan)業(ye)(ye)化(hua)為兩大(da)主軸(zhou)，持續貫(guan)徹教(jiao)(jiao)學(xue)品質與績效的(de)目標。
在研(yan)(yan)(yan)究(jiu)方面，頂尖(jian)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)是國(guo)際一(yi)(yi)流(liu)大(da)學(xue)不可(ke)或缺之一(yi)(yi)環，臺北醫學(xue)大(da)學(xue)過去幾(ji)年來，研(yan)(yan)(yan)究(jiu)水準已(yi)有(you)長(chang)足的(de)進步。為持續朝向世界前五百(bai)大(da)頂尖(jian)大(da)學(xue)，學(xue)校順應(ying)國(guo)際趨勢，極力爭取(qu)大(da)型(xing)及整合(he)(he)型(xing)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)計劃，延攬(lan)國(guo)內外杰出人才(cai)及其團隊，提高(gao)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)獎(jiang)勵(li)，并建立與國(guo)際一(yi)(yi)流(liu)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)單位(wei)合(he)(he)作(zuo)關系。
在醫療(liao)方面，隨著教學研究的(de)成(cheng)長，該(gai)校醫療(liao)體系也(ye)日漸茁壯。臺北(bei)醫學大學擁有附(fu)設醫院(yuan)、萬芳醫院(yuan)、雙和醫院(yuan)，三所附(fu)屬(shu)醫院(yuan)，近(jin)三千床(chuang)之(zhi)規模，是為臺北(bei)地(di)區醫學院(yuan)校最大之(zhi)醫療(liao)體系。臺北(bei)醫學大學統合(he)學校及三附(fu)屬(shu)醫院(yuan)的(de)資(zi)源，在見、實習與(yu)臨床(chuang)技能訓練上(shang)，具有完(wan)整的(de)設備與(yu)空間，更以服務鄰近(jin)社區，保障國(guo)人健康為職志。
洪奇昌：民主(zhu)進步黨(dang)立(li)法(fa)委員
林益世：國(guo)民(min)黨立(li)法(fa)委員
侯文(wen)詠(yong)：麻醉醫師、知名作家
張洪量：牙醫系畢業(ye)，流行音樂歌手、制作人
隆中隱：知名中國音樂教育者
陳(chen)以生：牙醫系學士、口(kou)研所(suo)碩士，流行音樂歌手(shou)
陳子(zi)忠：醫技系學士、中(zhong)港臺(tai)醫療管(guan)理人員
李良雄：臺(tai)北(bei)榮民總醫院院長
1958年，創(chuang)辦(ban)人胡水旺先(xian)生、徐千田先(xian)生籌設(she)北醫(yi)。
1960年(nian)，北醫創立，當(dang)時有醫學(xue)系(xi)(xi)、牙醫學(xue)系(xi)(xi)及藥(yao)學(xue)系(xi)(xi)三(san)系(xi)(xi)。
1963年，成立(li)護(hu)理助產(chan)專(zhuan)(zhuan)修科(ke)，招收五(wu)專(zhuan)(zhuan)生。
1965年，成(cheng)立醫事(shi)技術專修(xiu)科，招收五專生。
1975年(nian)，醫事技術(shu)專修科改制為醫事技術(shu)學系。
1976年，設立臺(tai)北醫(yi)學大(da)學附(fu)設醫(yi)院。
1977年，護理助產(chan)專修(xiu)科改制為(wei)護理學(xue)系。
1979年，成(cheng)立保(bao)健營養學系。
1989年(nian)，成立公共衛生學系(xi)。
1989年，成立天然物醫學研究所。
1990年，胡俊(jun)弘先生接任校長，成立醫(yi)學研(yan)究所。
1992年，成(cheng)立口腔復健醫學研(yan)究所(suo)。
1993年，口腔復(fu)健(jian)醫學(xue)研(yan)究所(suo)改名(ming)為牙醫學(xue)研(yan)究所(suo)。天然物醫學(xue)研(yan)究所(suo)改名(ming)為醫學(xue)研(yan)究所(suo)。
1994年，成(cheng)立細(xi)胞及分子(zi)生物(wu)研究所。領(ling)先全國各校成(cheng)立「醫學(xue)資訊暨電子(zi)計算機中心」。
1995年，成立保(bao)健營養學(xue)研(yan)究所碩士(shi)班。護理學(xue)研(yan)究所碩士(shi)班。
1996年(nian)，接收臺北市(shi)政(zheng)府委托經營(ying)市(shi)立萬芳醫(yi)院。
1997年，成立(li)醫務管理學系。
1998年，成立生物(wu)醫學技術(shu)研究所、醫學資訊(xun)研究所。
1999年，成立生藥(yao)技(ji)術學系，是臺灣(wan)第一(yi)個中藥(yao)相關(guan)學系。由(you)當(dang)時藥(yao)學院院長楊玲玲教授所創立,但由(you)於藥(yao)師(shi)全(quan)聯(lian)會的反對,迫使2007年停止招(zhao)生。
2000年(nian)，改名「臺北醫(yi)(yi)學(xue)(xue)大學(xue)(xue)」，成立醫(yi)(yi)務管理研究(jiu)所(suo)(suo)、生物醫(yi)(yi)學(xue)(xue)材(cai)料(liao)研究(jiu)所(suo)(suo)。
2001年(nian)，成立呼吸治療學(xue)系(xi)、口腔衛生學(xue)系(xi)。
2002年(nian)，成立藥(yao)理學(xue)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)所(suo)(suo)、口腔科(ke)學(xue)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)所(suo)(suo)、保(bao)健營養研(yan)(yan)(yan)究(jiu)所(suo)(suo)博(bo)士班。
2003年，通過衛生署甄選，籌建雙(shuang)和醫院，并(bing)成立醫學人文研(yan)究所。
2004年，成立神經科學研究所。
2006年(nian)，口腔(qiang)科學(xue)(xue)研究所(suo)(suo)與(yu)生醫(yi)(yi)材料研究所(suo)(suo)合并(bing)，改名為生醫(yi)(yi)材料暨工程研究所(suo)(suo)。護(hu)理學(xue)(xue)研究所(suo)(suo)博士班(ban)成立(li)、醫(yi)(yi)事技(ji)術學(xue)(xue)系改名為醫(yi)(yi)學(xue)(xue)檢驗暨生物技(ji)術學(xue)(xue)系。
2007年，成立牙體技術(shu)學(xue)(xue)系(xi)、老人護理(li)暨管理(li)學(xue)(xue)系(xi)。由原(yuan)先的醫學(xue)(xue)研究(jiu)所(suo)(suo)基礎(chu)組、細胞及分子(zi)生物研究(jiu)所(suo)(suo)、醫學(xue)(xue)檢(jian)驗暨生物技術(shu)學(xue)(xue)系(xi)碩士班、藥(yao)理(li)學(xue)(xue)研究(jiu)所(suo)(suo)及神經(jing)科(ke)學(xue)(xue)研究(jiu)所(suo)(suo)五所(suo)(suo)整合為(wei)醫學(xue)(xue)科(ke)學(xue)(xue)研究(jiu)所(suo)(suo)。
2008年，附屬醫院(yuan)-雙和醫院(yuan)於(wu)7月1日開(kai)始營運、邱文達教(jiao)授接任(ren)校長
2009年(nian)，醫務管理(li)學系并入(ru)公共(gong)衛生(sheng)暨營養(yang)學院，開(kai)始招收碩士班國際學生(sheng)。
2010年，成立(li)醫學(xue)科技(ji)學(xue)院、人文暨社會科學(xue)院。
2011年，榮(rong)獲QS亞洲頂尖大學前百(bai)大。連續六年獲教育部補(bu)助近4億元。
2011年，邱文達校長(chang)榮(rong)陞(sheng)衛生署(shu)(shu)署(shu)(shu)長(chang)，閻云教授(shou)接任北醫(yi)第九任校長(chang)。
2013年，老人(ren)護理暨管理學系更名為高齡(ling)健康管理學系。
2014年，藥(yao)學(xue)系(xi)分(fen)設藥(yao)學(xue)組、臨床藥(yao)學(xue)組。
2015年，成立(li)管理(li)學(xue)院，并(bing)將公共(gong)衛生暨營養學(xue)院中的「醫務管理(li)學(xue)系（學(xue)士班(ban)、碩(shuo)士班(ban)、碩(shuo)士在職專班(ban)）」整(zheng)并(bing)至管理(li)學(xue)院。
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